Σημαντική επιβάρυνση στη τελική τιμή χονδρικής του ηλεκτρισμού προκαλούν οι απώλειες ηλεκτρικής ενέργειας στο σύστημα, οι οποίες αυξήθηκαν σημαντικά από τον Ιούλιο και μετά, όταν λειτούργησε η διασύνδεση Κρήτης- Πελοποννήσου.
Το κόστος των απωλειών προσαυξάνει την τιμή που διαμορφώνεται στην Αγορά Εξισορρόπησης, η οποία προστίθεται στις πολύ υψηλές τιμές χονδρικής που διαμορφώνονται καθημερινά στην Αγορά Επόμενης Ημέρας και στο τέλος μετακυλίονται στους καταναλωτές.
Από τον Ιούλιο και μετά τα στοιχεία του ΑΔΜΗΕ δείχνουν αύξηση των απωλειών του συστήματος άνω του 40%. Το ρεκόρ καταγράφηκε τον Δεκέμβριο, όταν οι απώλειες έφθασαν στις 160.952 MWh.
Τα προηγούμενα χρόνια αλλά και το 2021 οι απώλειες τους περισσότερους μήνες κινούνταν κάτω από τις 100.000 MWh
Σύμφωνα με τα στοιχεία, τον Ιανουάριο του 2021 οι απώλειες του συστήματος ήταν 114.367 MWh, τον Φεβρουάριο 102.669 MWh, τον Μάρτιο 95.078 MWh, τον Απρίλιο 88.617 MWh, τον Μάιο 89.140 MWh, το Ιούνιο 95.688 MWH.
Η απότομη εκτίναξη των απωλειών έγινε τον Ιούλιο, όταν διασυνδέθηκε η Κρήτη στο Σύστημα : Tον Ιούλιο οι απώλειες έφθασαν στις 141.808 MWh, τον Αύγουστο στις 139.568 MWh, τον Σεπτέμβριο στις 127.422 MWh, τον Οκτώβριο στις 138.622 MWh, τον Νοέμβριο στις 134.614 MWh και τον Δεκέμβριο στις 160.952 MWh, μήνα κατά τον οποίο η συμμετοχή της Κρήτης στη ζήτηση του Συστήματος ήταν πολύ περιορισμένη στις 15.232 MWh, έναντι 65.274 MWh τον Αύγουστο λόγω της τουριστικής κίνησης.
Οι απώλειες του συστήματος τιμολογούνται με τη χρέωση uplift 1, την μία από τις τρεις χρεώσεις που συνθέτουν την τελική τιμή στην Αγορά Εξισορρόπησης. Τον Μάιο η τιμή του uplift 1 ήταν 1,51 ευρώ/MWh και το συνολικό κόστος της Αγοράς Εξισορρόπησης ήταν 8,62 ευρώ/MWh. Τον Ιούνιο η τιμή uplift 1 ήταν 1,75 ευρώ/MWh και το σύνολο της Αγοράς Εξισορρόπησης 13,84 ευρώ/MWh. Tον Ιούλιο η uplift 1 αυξήθηκε στα 3,74 ευρώ/MWh και τον Δεκέμβριο έφθασε στο 9,74 ευρώ/MWh με το συνολικό κόστος της Αγοράς Εξισορρόπησης να διαμορφώνεται στα 21,08 ευρώ/MWh.
Η τιμή αυτή, τα 21, 08 ευρώ/MWh προστίθεται στη μέση τιμή χονδρικής της Αγοράς Επόμενης Ημέρας, η οποία τον Δεκέμβριο διαμορφώθηκε περίπου στα 235 ευρώ/MWh.